金陵協和神學院創建于1952年11月，在當時南京金陵神學院的基礎上，由華東地區11所神學院及圣經學校聯合而成，院長為丁光訓。1961年，位于北京的燕京協和神學院也加入，使聯合辦學的學校數增至12所。1966-1980年，因文化大革命而停課，1981年2月恢復辦學，院長仍為丁光訓主教。2010年3月，董事會聘請丁光訓主教為名譽院長、高峰牧師為院長、陳逸魯牧師為常務副院長、王艾明牧師為副院長。2012年現有專職教師22位，其中有博士學位3人，還有5位在海外神學院攻讀博士學位;現在有本科研究科學生310人，教牧研究生53人，函授學生1000人。現校址：江蘇省南京市江寧大學城樵歌路100號。

金陵協和神學院是目前國內唯一一所全國性神學院，面向全國招生。1981年恢復招生以來，還承擔著為各兄弟神學院校培養師資、為各地兩會培養各種專門人才的任務，加上老一輩教師的影響，形成了金陵協和神學院教研并重的學術傳統。學院除主動組織各種形式的研討會、邀請國內外知名學者來院演講外，還鼓勵、支持老師積極參加學術界組織研討會。學院出版部也組織力量，出版各種神學專著，尤其是出版本院老師教學之余的研究成果。學院長年堅持出版學術期刊《金陵神學志》，以及面向基層教會義工的《教材》。

作為一所具有國際知名度的學院，也是全國唯一一所具有聘請外教授課資格的神學院。金陵協和神學院本著獨立自主的原則，積極開展對外交往，接待世界各地基督教知名領袖、學者和教會人士。通過報告會、研討會和座談會等形式，與來訪的客人進行多方面的交流，增進了解，促進友誼。例如，今年10月，我們成功地承辦了“第八屆基督宗教在當代中國社會的作用及其影響”高級論壇。同時，也派遣本院老師出國(境)訪學，參加國際基督教會議或進修。這些活動，擴大了學院的影響，使更多的海外朋友了解到我國的宗教信仰自由政策。同時，這些活動也有助于開闊學生視野，提高他們的思想境界，激發他們的學習熱情。總之，積極的對外交往，為學院贏得世界基督教界廣泛的理解與支持、提高學院辦學水平、推進學院學術研究等方面，都有積極的影響。

金陵協和神學院自1952年創校時，就坐落在南京市鼓樓區大锏銀巷，原金陵女子神學院所在地。校園占地不足30畝，僅能容納學生200人。進入新世紀后，隨著中國基督教的發展，金陵協和神學院的辦學規模已難以適應教會發展。在中央和地方各級黨政部門的支持下，在南京江寧大學城內劃拔了200畝土地作為金陵協和神學院新校園用地，并得到中央財政的有力支持。在各方關懷下，金陵協和神學院新校園于2005年1月17日舉行奠基禮，正式開工建設。2009年3月，學院遷入新校園，擴大招生規模，爭取達到500人。

經過60年的辦學，金陵協和神學院的畢業生約2000人，除約46人移居海外以外，其余分布在32個省(市、自治區)，絕大多數工作在中國教會第一線，為中國教會健康發展，為維護社會穩定，為構建社會主義和諧社會作出了貢獻。

自創校以來，金陵協和神學院在黨和政府的大力支持下，在中國基督教全國兩會領導下，靠著全院師生和全國廣大基督徒的努力，遵循老院長丁光訓主教擬訂的辦學方針，堅持走愛國愛教的三自道路，培養靈、德、智、體、群全面發展的神學生，已經取得了豐碩的成果。

金陵協和神學院目前有四種學制：全日制本科，招收高中及以上學歷學生，學制4年，修讀完所有課程，考試合格，準予畢業，發給本科畢業證書，并有資格申請本院學士學位;全日制研究科，招收神學及普通高校本科畢業學生，學制3年，修讀完所有課程，考試合格，準予畢業，發給研究科畢業證書，并有資格申請本院碩士學位;非全日制教牧研究生班，招收全國各地已在教會工作若干年的教牧同工，學制2年半，每學期集中授課一次，每次約4-5周，修讀完所有課程，考試合格，準予畢業，發給教牧研究生班畢業證書;函授班，招收初中以上文化程度學員，學制3年，修讀完所有課程，考試合格，準予畢業，發給函授班畢業證書

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